責任主編：王顥中
環保團體28日召開記者會，呼籲林務局和林試所應完整併入環資部，維持原本組改目的，讓森林管理不分家。（攝影：陳逸婷）行政院組織改造原預計將隸屬於農業委員會的林務局與林業試驗所納入環境資源部，達到山、林、水、土為一家之目的，然而今年（2013）1月時有立委提案，要求修正原案，將林務局與林試所歸至農業部底下， 目前已進入立院黨團協商程序。環保團體28日召開記者會，呼籲林務局和林試所應完整併入環資部，維持原本組改目的，讓森林管理不分家。
地球公民基金會研究員呂翊齊表示，組織改造原案由行政院提出，稱為官方版本，1月3日《農業部組織法》的審查會議中有立委提出修正版本，將林務局與林試所歸給農業部。當時不僅組織法審查一團亂、更有媒體指出行政院、立法院不同調。唯一出現的官方說明是1月11日由林務局發出的新聞稿（相關連結），當中澄清「組改一切依循行政院規劃」，也寫明組改小組決議將部分林務局留在農業部。
呂翊齊認為，組改小組若要推翻行政院原本的規劃，應提出新版本，這個新版本卻一直沒有出現，反而只看到執政黨立委不斷在提修正動議，問農委會得到的回應也是「無新版本」、「遵照大院決議」等說法，整個組改過程一團混亂、極度不公開。
直到5月，環團才拿到一份農業部的說帖，當中提到：考量林業部門的林產物與森林副產物之直接生產價值，有必要於農業部組織架構中設置相關部門。環團因此召開記者會對說帖提出質疑，認為林業政策應著重於天然林保育工作，而非產業經濟價值，呼籲組改不要走回頭路。
地球公民基金會執行長李根政認為，原組改規劃將林務局與林試所併入環資部，有利於整體性地思考公、私有林的保育政策，像是建立全面性的生態補償政策。以屏東縣政府為例，為了保育重要林地，就曾主動以砂石回饋金作為補償，提供給土地所有人，他強調這種機制屬於「保育策略」而非「農業生產策略」。然而當前這種生態補償政策，不受到中央主管機關重視，因此更迫切需要整合性的組織改造，而非將林務切割給以經濟發展為前提、管理生產的農業部。
李根政表示，林務切割後，最令人擔憂的便是農業部在說帖中提到的「重啓林業生產」，林業生產包含砍伐大量木材、以提升造林自給率以及強化林業附加價值。他認為台灣的生態環境因為樹種過多且木材品質不均，必須要有妥善的林地分級機制為前提，否則不適合從事大規模的林業生產，但是目前缺少林地分級機制，從事生產將導致砍伐亂象；而強化林業附加價值的其中一種是推動「混農林業」，亦即有限度的核可森林中特定農業行為，導致農業上山合法化。種種跡象顯示，農業部以生產為主要政策走向，忽略森林保育的重要性，然而台灣國土脆弱，環團擔憂林地保育沒做好，會導致不可收拾的生態災難。
立委林淑芬認為組織改造應事權統一，現在走回頭路將造成事權的切割分裂，是「反其道而行」，並質疑既得利益者影響行政院決議，呼籲政府莫為了服務既得利益者做出錯誤的政策改變。李根政強調，不保證環資部可以解決所有保育問題，但從生產部門移轉到保育部門，會促使保育部門思考保育策略，透過整合流域與森林的集體管理，來發展完善的生態補償政策及配套措施。