蔡英文執政滿週年，各民間團體紛紛針對蔡政府的施政進行「總體檢」，在勞動政策、青年政策、長照政策、年金改革等方面皆被評低分，而在兩岸關係方面，蔡政府則因不承認「九二共識」及持續推動「去中國化」，使兩岸關係陷入急凍，不僅陸客人數銳減，衝擊觀光產業，民進黨也因調漲陸生在內的境外生的健保費、研擬「保防法」和「反滲透法」等政策引發反彈。
蔡英文選前提出的兩岸政策，聲稱要「維持兩岸現狀」，回歸1992年兩岸會談基本事實「求同存異」，但一年來兩岸關係的發展卻不斷惡化，觀光產業、陸生權益首當其衝。
陸客遽降 導遊、遊覽車生意皆受衝擊
據內政部移民署統計資料，今年（2017）1至4月，陸客來台旅遊總人數為61萬524人，較去年同期下降50.2%；觀光局最新統計資料也顯示，今年1至3月來台觀光旅客負成長近14%，減少28萬多人，其中以陸客衰退近42%最多。
中華民國遊覽車客運商業同業公會全聯會理事長魯孝亞表示，蔡英文上任後，專做陸團的遊覽車受到的衝擊「非常嚴重」，因為生意慘淡，剩不到兩成在跑，約4千多輛專做陸團的遊覽車轉去做國民旅遊和國外觀光客的生意，但原本國民旅遊市場就有9千多台遊覽車在跑，因車輛過剩只能削價競爭，市場擠壓下導致很多業者倒閉、欠債。
魯孝亞直言，觀光產業陷入困境，蔡政府的兩岸政策「不及格」要負很大責任，雖然蔡政府說要發展新南向政策，但新南向市場無法消化大量陸團遊覽車沒生意的問題。魯孝亞認為，兩岸已是共同經濟體，為了台灣經濟，兩岸勢必要有正常的交流，而不是把大陸市場排除在外，但現在政府和對岸協商機制停擺，「當然看不到希望」。
中華民國觀光導遊協會理事長伍永益也表示，陸客人數負成長，對導遊業來說衝擊最大的是約2萬9千名華語導遊，佔台灣導遊總人數77%。他表示，政府因應新南向政策，雖提供外語訓練協助轉型，但轉型並非這麼容易，原本有300多家旅行社專營大陸旅客，政府想讓它們改做國民旅遊，聘用華語導遊，但原本就存在專營國民旅遊的旅行社，因此客源也成問題，「這些旅行社沒接到團，華語導遊也沒得工作，兩者都受影響。」
伍永益指出，東南亞旅客和外國旅客人數近期有微幅成長，但是否有益於觀光產業和總體經濟不能只看表面人數，觀光外匯收入靠的是旅客購物能力，而外國觀光客的購買力一向不如陸客。他強調，兩岸人民觀光交流的榮景，是花了長時間經營才達到的結果，期盼政府用各種管道去溝通，「把心結打開，這對台灣是有利的。」
陸生納保案 民進黨趁機調漲境外生保費
此外，蔡政府上台後，「陸生納入全民健保」議題也成為爭議焦點之一。大陸學生作為兩岸人民和平交流的前鋒，台灣政府對陸生的政策卻稱不上友善，這種態度在「陸生納保」的議題上尤為明顯。
早在2015年國民黨執政期間，立法院就曾討論過陸生納保的可行性。在完全支持的國民黨與完全反對的台聯之間，民進黨看似是對陸生態度溫和的中間派，並宣稱納入健保可行，卻也要求陸生付出比台灣學生更高的全額保費，將這些無收入、不能打工，在經濟上相對弱勢的陸生，比照月收入高達8萬新台幣的台灣受僱者收取保費。
民進黨上台後，同樣拋出了陸生納保的議題，然而這個舉動不但沒有促成台灣人民與大陸學生的相互理解，反而引發台灣人民強烈的排外情緒，另一方面也掩飾台灣政府在「新自由主義」之下，縮小公共支出、減少公共服務的決策。
2016年10月，蔡英文透過府院黨高層組成的「執政決策協調會議」，確定將陸生納入健保，同時不僅維持對陸生保費自負的要求，更取消過去衛福部提供給僑生與外籍生的保費減免補助。
包含陸生、僑生與外籍生在內的所有境外生，在今年年初組成了「境外生權益小組」，協同台灣人權促進會、公共衛生促進協會等團體，針對此項排外的差別待遇政策持續提出批判。他們強調：全民健保不是專屬於台灣「國民」的人權，應該衡量被保險人的經濟能力計算保費，不該對來台進行學術交流的學生有差別待遇。然而，民進黨政府在3月下旬發動立院閃電戰，火速通過一讀和朝野協商，至今草案仍在攻防之中。
來自馬來西亞的境外生權益小組成員黃康偉認為，蔡英文政府透過陸生納保的契機，對社會上相對弱勢、最被污名化的境外生群體追加經濟負擔，實際上正是表現了民進黨的新自由主義特質，他擔憂如果未來「保費全額自付」，社會保險商品化現象恐怕會逐步擴張到台灣學生與勞工身上。
蔡英文誤判兩岸局勢 與區域一體化趨勢背道而馳
今年民進黨政府一連串的政策研議，包含「保防法」、「反滲透法」的出台，「中轉大陸必須報准」等政策，也引起「戒嚴時期的『人二室』復辟」，「加強國家管控」、塑造「保密防諜」氛圍等質疑，白色恐怖受難者團體也擔憂一個全新的「反共戒嚴體制」正在成形。
中華兩岸和平發展聯合會副主席陳福裕表示，「保防法」和「反滲透法」的推動和倡議，反映的是民進黨的統治手法並未走出國民黨軍事戒嚴體制的陰影，也就是透過將中國大陸建構為強大的威脅和敵人，合理化對內整肅和統治的正當性。他指出，民進黨當年以自由主義為口實反對國民黨，如今卻走到它自己的對立面，顯示過去30年台灣的民主改革是失敗的，只體現了政黨輪替，而無實質的民主內涵。
對於「中轉大陸必須報准」的政策，陳福裕也相當不以為然，認為兩岸關係開放交流至今已30年，從冷戰時期的堅壁清野，到今天是「你中有我我中有你」，台灣有數十萬陸配，在大陸就業及就學的台灣人有200萬人，每年兩岸往來人次高達500萬，「規定中轉還要報備報准，不是非常荒謬嗎？」
陳福裕指出，蔡英文的兩岸政策有兩個重大誤判，一是仍停留在上世紀的冷戰對抗思維，企圖運用冷戰遺留的區域安全架構，在美日的軍事保護傘底下，實現和北京相對抗的格局。然而，當美日都積極投入到亞投行和「一帶一路」這樣的區域一體化發展進程時，蔡英文卻還想維持冷戰區域安全架構，他認為這是不切實際且不符合台灣社會利益的。
陳福裕分析，蔡英文的第二個誤判是把兩岸之間的矛盾，也就是國家或民族內部的矛盾，外部化為集團對抗性的矛盾，「這是很危險的，很難有轉圜機制」。然而，最近浮現的美日和大陸合作開發、共同發展的趨勢，也使得蔡英文的戰略喪失依據，「她目前的焦慮也在於此」。
陳福裕直言，儘管蔡政府喊出新南向政策，但如果不能妥善解決兩岸問題，在大陸的支持底下，參與東南亞區域一體化，那麼新南向政策同樣也缺乏實在的依據和配套措施，只不過是執政者的「主觀願望」而已。陳福裕強調，在區域一體化的大趨勢下，台灣沒有理由成為「唯一的例外」，而兩岸關係，確實是蔡政府必須繳交的答卷。